肝組織中核酸的分離與鑒定
【 實(shí)驗(yàn)?zāi)康摹?/span>
1 .掌握 DNA 分離純化的原理和方法。
2 .熟悉臺(tái)式離心機(jī) 的使用。
3. 掌握 DNA 定量技術(shù)。
【 實(shí)驗(yàn)原理】
細(xì)胞內(nèi)的核酸多以核蛋白的形式存在,其中脫氧核糖核蛋白主要存在于細(xì)胞核 中,核糖核蛋白主要存在于細(xì)胞質(zhì)中。這兩類核蛋白在 0.14mol / L 氯化鈉溶液中的溶解度相差很大,核糖核蛋白在此溶液中具有很高的溶解度,脫氧核糖核蛋白的溶解度卻相當(dāng)?shù)汀V瞥筛蝿驖{后,用 0 . 14mol / L 氯化鈉溶液抽提,可將兩種核蛋白分離。分離過程中加入少量檸檬酸鈉,可抑制脫氧核糖核酸酶對(duì) DNA 的水解作用。
SDS( 十二烷基硫酸鈉 ) 能使脫氧核糖核蛋白產(chǎn)生解聚作用,在含有脫氧核糖核蛋白的溶液中加入 SDS , DNA 即與蛋白質(zhì)分離開,用氯仿將蛋白質(zhì)沉淀除去,而 DNA 溶解于水相,最后用冷乙醇將 DNA 析出,而獲得純化的 DNA 。在氯仿中加入少量異戊醇能減少操作過程泡沫的產(chǎn)生,并有助于分相,使離心后的上層水相,中層變性蛋白,下層有機(jī)溶劑相維持穩(wěn)定。 DNA 和 RNA 在波長 260nm 處有很高的吸收峰值,蛋白質(zhì)則在 280nm 處有很高的吸收峰值。
利用這個(gè)原理,測(cè)定純化樣品在 260nm 和 280nm 處的吸光度,可以推算出樣品中 DNA 的濃度,并判斷其純度。在標(biāo)準(zhǔn)條件下,當(dāng) A260 = 1 時(shí),樣品中雙鏈 DNA 濃度為 50 μg/ml ,單鏈 DNA 濃度為 40 μg/ml 。純凈的 DNA 樣品 A260/A280 的比值約為 1.8 ,樣品中含有蛋白質(zhì)或其它雜質(zhì),會(huì)使 A260/A280 的比值下降。
【 器材和試劑】
1. 器材 玻璃勻漿器、離心機(jī) 、試管、刻度吸管、紫外可見分光光度計(jì)
2. 試劑
1. 0.9 %氯化鈉溶液
2. 10 %氯化鈉溶液
3. 0.14 mol/L 氯化鈉溶液 ( 含 0.01 mol/L 檸檬酸鈉 ) :稱取氯化鈉 8.182g 和檸檬酸鈉 2H2O 2.941g ,用蒸餾水溶解并稀釋至 1000m 1
4. 95 %乙醇溶液 ( 冷藏 )
5. 5 %十二烷基磺酸鈉 (SDS) 溶液 : 稱取 25 克 SDS 溶于 500m 1 45 %乙醇
6. 氯仿 - 異戊醇混合液:氯仿 : 異戊醇 =24:1
7. 0.1 mol/L NaOH
【 操作步驟】
1 .肝勻漿制備:新鮮豬肝,用 0.9 % NaCI 洗去血液,除去結(jié)締組織,剪碎,稱取 4g 肝組織,加 4ml 0.14mol / L NaCl 溶液,勻漿器中研磨,制成肝勻漿。
2 .分離核蛋白:肝勻漿倒入試管中, 4000r/min 離心 5min ,上清棄去。沉淀加 2 m 1 0.14 mol/L NaCl 攪勻后再置勻漿器中研磨, 4000r/min 離心 5min ,上清棄去,沉淀重復(fù)上述操作,上清棄去,沉淀為 DNA- 蛋白質(zhì)復(fù)合物。
3 .沉淀中加 0.14mol/L NaCl 2.0ml ,攪勻,滴加 5 % SDS 2.0m1 ,邊加邊攪, 60 ℃ 水浴 10 min( 不停攪拌 ) ,冷至室溫,均勻分成兩管為 Bl 、 B2 。
4 . B1 、 B2 管中各滴加氯仿 - 異戊醇液 4.0m 1( 邊加邊攪 ) ,攪至溶液顏色均勻, 3000r/min 離心 15min 。溶液分三層,上層液為水相 ( 含 DNA) ,中層為蛋白質(zhì)沉淀,下層為有機(jī)相,吸取 B1 、 B2 上層液合倒于另一試管中。
5 .上清液加 95 %冷乙醇 4.0m 1 ,混勻 ( 顛倒混勻法 ) , 3000r/min 離心 15min ,去上清液,沉淀為純化 DNA 。
6 . DNA 的溶解:沉淀中加入 0.1 mol/L NaOH 4.0ml ,攪拌溶解, 2000r/min 離心 10min ,上清液則為 DNA 水解液。
7 . DNA 的測(cè)定:用 0.1mol/L NaOH 將樣品稀釋到一定濃度,以 0.1mol/L NaOH 調(diào)零,測(cè)定樣品的 A260 和 A280 ,計(jì)算出每克肝組織中的 DNA 含量,并判斷純化 DNA 的純度。
【 注意事項(xiàng)】
1 .在制備肝勻漿時(shí),應(yīng)盡量在冰冷條件下進(jìn)行,并盡快加入含 0.0l mol / L 檸檬酸鈉的 0.14mol/L 氯化鈉溶液,以抑制脫氧核糖核酸酶 ,防止 DNA 的分解,以提高核酸得量。
2 .各步驟操作應(yīng)力求準(zhǔn)確,盡量減少中途核酸的丟失,保證定量測(cè)定的準(zhǔn)確性。
3 .稀釋后應(yīng)該盡量使樣品 A260 和 A280 處于 0.1-0.7 的范圍內(nèi)。
二、肝組織中 RNA 的分離與鑒定
【 實(shí)驗(yàn)?zāi)康摹?/span>
1 .掌握 RNA 分離純化的原理及操作方法
2 .掌握 RNA 定量技術(shù)
【 實(shí)驗(yàn)原理】
根據(jù)前面所述, DNA 和 RNA 這兩類核蛋白在 0.14mol / L 氯化鈉溶液中的溶解度不同,制成肝勻漿后,用 0.14mol / L 氯化鈉溶液抽提,可將兩種核蛋白分離 。在含有核糖核蛋白的 0.14mol / L 氯化鈉溶液中,調(diào)節(jié) pH 至 4.2 ,使其達(dá)到等點(diǎn)電,核糖核蛋白即從溶液中沉淀出;用熱的 10 %氯化鈉溶液抽提核糖核酸,最后用冷乙醇將核糖核酸鈉析出,而獲得純化的 RNA 。
分離過程中注意 RNase 的活性,防止 RNA 的降解。 RNase 無處不在,且耐高溫, RNA 的提取條件比 DNA 要嚴(yán)格得多,常采用 DEPC( 焦碳酸二乙酯 ) 來抑制 RNase 的活性。樣品中 RNA 的濃度及純度測(cè)定,與前相同,在此不再贅述,純度較高的 RNA 樣品, A260/A280=1.8 ~ 2.0 ,如果 A260/A280 < 1.8, 說明樣品中含有蛋白質(zhì)等,可用苯酚 - 氯仿抽提除去。
【 器材和試劑】
1. 器材 玻璃勻漿器、離心機(jī)、紫外可見分光光度計(jì)、試管、刻度吸管
2. 試劑
(1) 0.9 %氯化鈉溶液
(2) 10 %氯化鈉溶液
(3) 0.14mol / L 氯化鈉溶液 ( 含 0.01 mol / L 檸檬酸鈉 ) :稱取氯化鈉 8.182g 和檸檬酸鈉 ·2H2O 2.941g ,用蒸餾水溶解并稀釋至 1000m 1
(4) 10 %乙酸溶液
(5) 95 %乙醇溶液 ( 冷藏 )
(6) 0.1mol/L NaOH
【 操作步驟】
1 .肝勻漿制備:新鮮豬肝,用 0.9 % NaCl 洗去血液,除去結(jié)締組織,剪碎,稱取 4g 肝組織,加 4m 1 0.14mol/L NaCl 溶液,勻漿器中研磨,制成肝勻漿。
2 .分離核蛋白:肝勻漿倒入試管中, 4000r/min 離心 5min ,上清倒入另一試管中為 A 管。沉淀加 2m 1 0.14mol / L NaCI 攪勻后再置勻漿器中研磨, 4000r/min 離心 5min ,上清倒入 A 管,沉淀重復(fù)上述操作,上清并入 A 管,沉淀?xiàng)壢ァ?/span>
3 . A 管用 10 %乙酸調(diào) pH 至 4.2 ,混勻,靜置 5min , 4000r/min 離心 5min ,傾去上清,沉淀含核糖核蛋白。
4 . A 管沉淀中加 3m 1 10 % NaCI ,攪勻, 100 ℃ 水浴 10min( 不斷攪拌,防沸溢出 ) ,冷卻, 4000r/min 離心 5min ,留上清液。
5 . A 管上清液加 95 %冷乙醇 5m 1 ,見乳白色核糖核酸鈉沉淀,混勻放置 10min , 4000r/min 離心 15min ,沉淀為純化 RNA 。
6 . RNA 的溶解:沉淀中加入 0.1 mol/L NaOH 4.0ml ,攪拌溶解, 2000r/min 離心 10min ,上清液則為 RNA 水解液。
7 . RNA 的測(cè)定:用 0.1mol/L NaOH 將樣品稀釋到一定濃度,以 0.1mol/L NaOH 調(diào)零,測(cè)定樣品的 A260 和 A280 ,計(jì)算出每克肝組織中的 RNA 含量,并判斷純化 RNA 的純度。
【 注意事項(xiàng)】
1 .在制備肝勻漿時(shí) , 在進(jìn)行。在冰浴中進(jìn)行,全部操做過程注意抑制 RNase 活性。
2 .各步驟操作應(yīng)力求準(zhǔn)確,盡量減少中途核酸的丟失,保證定量測(cè)定的準(zhǔn)確性。
3 .稀釋后應(yīng)該盡量使樣品 A260 和 A280 處于 0.1-0.7 的范圍內(nèi)。
【 思考題】
1. 分離 RNA 時(shí)為何使用濃鹽 ?
2. 如何判斷所提取的 DNA 的純度 ?
3. 分離純化 DNA 時(shí)通常使用什么試劑
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